Η ΕΥ μαζί με το HPCS επιμελήθηκε την ασφάλεια της αρχικής έκδοσης της ψηφιακής πλατφόρμας.

Η ασφάλεια των συναλλαγών αποτελεί μέγιστη προτεραιότητα για το HPCS.

Η ανταλλασσόμενη πληροφορία είναι η ελάχιστη απαραίτητη για την πραγματοποίηση της κάθε συναλλαγής. Η πρόσβαση σε αυτή διαφυλάσσεται με μια σειρά τεχνικών μέτρων ασφαλείας όπως η χρήση κωδικών πρόσβασης μιας χρήσης, χρήση κρυπτογραφημένων καναλιών επικοινωνίας, διάχυση της πληροφορίας μόνο στα εμπλεκόμενα μέλη και ταυτοποιημένη πρόσβαση σε αυτή.
Κάθε συναλλασσόμενος γνωρίζει μόνο την πληροφορία που του έχει αποσταλεί από τον προηγούμενο συναλλασσόμενο, όπως και τον επόμενο συναλλασσόμενο που θα αποφασίσει να στείλει εκείνος πληροφορίες με την σειρά του την χρονική στιγμή που θα επιλέξει.

Συνεπώς, η διακινούμενη πληροφορία είναι γνωστή μόνο σε όσους απαιτείται να τη γνωρίζουν διαφυλάττοντας την εμπιστευτικότητα των πληροφοριών.

Η πλατφόρμα είναι πλήρως συμβατή με τις επιταγές τόσο της Ελληνικής, όσο και της Ευρωπαϊκής νομοθεσίας περί προσωπικών δεδομένων. Τόσο οι υποδομές, όσο και η λειτουργία της πλατφόρμας υπόκεινται σε ενδελεχείς ελέγχους από εξωτερικούς ελεγκτές σε ετήσια βάση.
Τέλος, το HPCS υποστηρίζεται από μια εξειδικευμένη ομάδα μηχανικών 365 ημέρες το χρόνο, 24 ώρες το 24ωρο με τη χρήση εξελιγμένων εργαλείων παρακολούθησης της ασφάλειας και της εύρυθμης λειτουργίας της πλατφόρμας.